5 ноября 1948 г. Совет Министров СССР принял постановление, в котором Ми­нистерству рыбной промышленности предписывалось организовать в г. Кали­нинграде Балтийский филиал Всесоюз­ного научно-исследовательского института морского рыбного хозяйства и океанографии (ВНИРО) с целью про­ведения исследований в Балтийском и Северном морях, Северной Атлантике. Весной 1949 г. филиал был создан. Здание института построено на базе полуразрушенной дерматологической клиники Кёнигсбергского универси­тета. В 1950 г. состоялась первая морская экспедиция в Северное море. К этому времени в филиале работало около 50 сотрудников, а исследования проводились на единственном судне -СРТ-308 "Алазань".

С годами акватория исследований рас­ширялась, улучшалась материально-тех­ническая база, флот пололнялся новыми судами. В 1956 г. филиал был реоргани­зован в самостоятельный институт -БалтНИРО, в 1962 г. - преобразован в Атлантический научно-исследователь­ский институт рыбного хозяйства и оке­анографии (АтлантНИРО).
Сегодня АтлантНИРО - ведущий науч­но-исследовательский институт Рос­сии по изучению сырьевой базы рыболовства в Балтийском море, цен­тральной и южной частях Атлантичес­кого, юго-восточной части Тихого и западной части Индийского океа­нов. Цель исследований - создание научных основ рациональной эксплу­атации биоресурсов и эффективного их использования на базе современ­ных технологий.

В институте около 350 работников, из них 260 научных сотрудников и инже­неров, 51 имеет ученую степень.

Научно-исследовательские суда и ла­боратории института оснащены совре­менным оборудованием, в работе используются новейшие методы ис­следований.

АтлантНИРО является государствен­ной научной организацией, имущество которой находится в федеральной собственности.

Научно-исследовательская деятель­ность института осуществляется в двух направлениях: биологическом и техно­логическом, каждое из которых воз­главляется заместителем директора.

Технологическое направление обеспечивает исследования практически во всех областях технологии обработки гидробионтов.

   Основные задачи

Проведение научно-исследов работ в области технологии продуктов из гидробионтов, сырья животного и растительного происхождения;

Разработка и внедрение прогрессивных ресурсосберегающих и экологически чистых технологических процессов перереработки гидробионтов, сырья животного и растительного происхождения;

 Совершенствование технологии производства традиционной продукции из промысловых гидробионтов;

Проведение маркетинговых исследований и разработка прогноза развмтия научно-технического прогресса в области
переработки гидробионтов;

Проектирование технологической части проектов рыбообрабатывающих линий, производств и заводов,

разработка рекомендаций по составу технологического оборудования, предложений по проектированию рыбообрабатывающих цехов и заводов;

 Содействие выпуску партий продукции из гидробионтов по разработанным технологиям на экпериментальном и промышленном оборудовании.